Di norma gli assegni familiari per i dipendenti vengono pagati dal datore di lavoro insieme al salario. Il pagamento viene effettuato non appena la cassa di compensazione ha preso la relativa decisione di assegnazione.

Il pagamento degli assegni familiari ai dipendenti avviene sotto forma di compensazione tra i contributi della cassa di compensazione AVS e quella per gli assegni familiari. Con il conteggio, vengono inviati anche i cosiddetti «dettagli CAF» contenenti informazioni dettagliate per ogni beneficiario degli assegni familiari.